Товарооборот между Башкирией и Чехией составил долларов 1,15 млрд По итогам 2011 года товарооборот составил 1,15 млрд долларов США, в том числе экспорт — 1,13 млрд долларов, импорт — 22,9 млн долларов. В структуре импорта преобладает оборудование (76,4 процентов), керамическая плитка.
Также представлены химическая продукция, изделия из черных и цветных металлов, пластмасса, изделия из стекла. Основной экспортной товарной позицией является сырая нефть — 99,7 процентов. На экспорт также поставляются органические химические соединения, керамические изделия, оборудование.
В структуре импорта преобладает оборудование (76,4 процентов), керамическая плитка. Также представлены химическая продукция, изделия из черных и цветных металлов, пластмасса, изделия из стекла. По состоянию на конец марта 2012 года объем накопленных чешских инвестиций в экономике Башкирии — 26,4 млн долларов США (2,2 процентов от общего объема накопленных иностранных инвестиций). В регионе работает семь предприятий с участием чешского капитала.